简单来说：
横向的就是和企业联系的主要用于解决实际问题的课题！纵向的是由国家或省市科技主管部门拨款的课题，多数是一些基金项目如国家自然科学基金，省（市）自然科学基金等，还有写攻关项目等！两者主要的区别是钱的来源一个是企业一个是国家！
横向项目
横向项目是横向科技项目的简称，属科技项目的一种。
科技项目包括纵向科技项目和横向科技项目。
横向科技项目指企事业单位、兄弟单位委托的各类科技开发、科技服务、科学研究等方面的项目，以及政府部门非常规申报渠道下达的项目。
申请文件的承担单位中没有本单位署名的纵向项目，由承担单位转拨本单位的子课题或者外协经费，一般也按横向项目对待。
由于横向项目主要不是由政府部门（或者受政府部门委托）下达的，其来源很广，较容易获得，因此，虽然其研究内容可能更贴近社会需要，研究经费也更多，但在科研评价体系中，横向项目的权重价值往往明显低于纵向项目。
纵向项目
纵向项目是纵向科技项目的简称，属科技项目的一种。
科技项目包括纵向科技项目和横向科技项目。
纵向科技项目是指上级科技主管部门或机构批准立项的各类计划（规划）、基金项目，包括：
国家级项目。一般指国家科学技术部、国家发展和改革委员会、国家财政部、国家自然科学基金委员会、国家社会科学基金委员会下达的项目）；
省部级项目。一般指省科技厅、省发展和改革委员会、财政厅、自然科学基金委员会下达的项目，以及除了国家科学技术部、国家发展和改革委员会、国家财政部以外的国家其他部委下达的部级项目；
市级和省厅局级项目。一般指市级项目以及省厅级、局级项目。
由于纵向项目是由政府部门（或者受政府部门委托）下达的，虽然经费不多，但带有一定的指导性，且很难获得，因此，纵向项目往往成为衡量一个单位（例如高等院校、科研机构）科研水平的重要指标，在科研评价体系中，具有比横向项目更高的权重价值－－虽然后者的经费往往成倍地大于前者。
纵向项目、横向项目界定的操作细则
一、纵向科研项目是指：
1）指列入国家、省委省政府及其下属科研主管部门各类科研规划的项目；
2）省委省政府及其政策研究部门委托我校进行研究、调研的项目；
3）上级党校、行政学院列入规划或委托我校进行研究、调研的项目；
4）其他党委政府部门、学术团体委托我校研究、调研，经科研处确认的项目。
纵向科研项目必须立项手续完备、经费到位（没有经费的委托项目以立项文件为准），经科研处、财务处确认。
二、纵向科研项目目录
I类（国家级项目）一般含：国家社会科学基金项目、国家自然科学基金项目、国家科技攻关项目、国家重点基础研究发展计划课题、国家教育规划项目、国家软科学研究计划项目、863高科技项目、国家教育部人文社科研究项目、国家国防科研项目。
II类（省级项目）一般含：省哲学社会科学规划课题、省自然科学基金项目、省科技攻关项目、省教育规划项目、省科技厅规划项目。
III类：省委省政府委托项目、校重点科研项目、省委省政府政策研究部门委托项目、中央党校国家行政学院规划或委托项目、省社联课题、省社联协作攻关课题、组织部宣传部委托项目、邓小平理论研究中心立项课题视同纵向科研项目。
三、除此以外的科研项目皆为横向科研项目。
四、纵向科研项目、横向科研项目在经费配套、成果统计、经费管理使用上按照相应的规定操作，纵向项目III类暂不收取管理费。
